民航運輸學院2022年9月成功獲批為上海市高水平高職專業群,2023-2025年專業群將依托民航，立足長三角區域一體化航空產業布局和上海國際航空樞紐港的區域經濟發展，圍繞現代民航運輸服務產業鏈，以民航運輸服務專業為核心，以航空物流管理、民航電子商務等專業為重點，促進專業資源整合和結構優化。專業群建設從加深專業的“深度”和拓寬服務的“維度”兩個方面進行推進，通過創新人才培養模式、優化課程體系和資源建設、強化師資隊伍、升級實訓條件和深化國際合作，到2025年將民航運輸服務專業群建成人才培養質量高、行校企融合深入、社會服務能力強的國內引領示範、國際有一定影響力的高水平專業群。
為了進一步深化專業建設、完善“1+X”證書製度試點工作、強化校企、配套浦東知行樓改擴建項目及整合龍華校區現有的民航運輸各類軟硬件設施設備，民航運輸學院完成了2023-2025年度民航局教育人才類運輸實驗室建設項目申報工作，7月完成民航局評委會的線上答辯。目前，該項目已正式獲批。民航運輸實驗室建設項目主要包括貨運與客運區兩大功能模塊。
